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Il repertorio della Schola spazia dalla polifonia classica (Palestrina, De Victoria), al barocco seicentesco e settecentesco (Bach, Haendel, Marcello), al classicismo mozartiano, all'Ottocento e al Novecento (Perosi). Particolare spazio è riservato a quei musicisti che, in diversi periodi storici, furono maestri di Cappella presso il Duomo di Milano (Fioroni, Quaglia, Gallotti, Spinelli, Migliavacca).
Per la prima volta, nel 2008, il gruppo si è cimentato nell'incisione di un CD. L'impegno è stato finalizzato, sotto il patrocinio della FIMP, alla realizzazione di un pozzo d'acqua potabile nel villaggio di Tan Barongane, Valle dell'Azawak in Nigeria.
Di seguito è riportato l'intero repertorio della Schola
• Jacob Arcadelt (1514-
• Giovanni Pierluigi da Palestrina (1525-
• Tomás Luis de Victoria (1548-
• Georg Friedrich Haendel (1685-
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• Antonio Lotti (1667-
• Johann Sebastian Bach (1685-
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• Benedetto Marcello (1686-
• Giuseppe Sarti (1729-
• Agostino Quaglia (1744-
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• Wolfgang Amadeus Mozart (1756-
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• Friedrich Heinrich Himmel (1765-
• Franz Schubert (1797-
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• Felix Mendelssohn Bartholdy (1809-
• Anselm Schubiger (1815-
• Salvatore Gallotti (1853-
alla terza Messa di Natale a 4 v.d. -
• Luigi Mapelli (1855-
• Lorenzo Perosi (1872-
a 4 v.d. -
dalla "Missa pontificalis" a 3 v.d.
• Zoltàn Kodaly (1882-
• Luigi Molfino (1916): O Sacrum Convivium, mottetto a 4 v.d.
• Luciano Migliavacca (1919): Siete venuti a prendermi, antifona a 4 v.d. -
mottetto a 4 v.d. -
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• Ariel Ramirez (1921-
• Santo Spinelli (1922-
• Franco Cazzulani (1954): dal XXXIII canto del "Paradiso" di Dante, Vergine Madre a 4 v.d.
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• Rihards Dubra (1964), O Crux, ave, a 4 v.d.